Növényi Fejlődésbiológia Csoport – Dr. Havelda Zoltán

Utolsó frissítés: 2017. április 13. csütörtök Megjelent: 2012. február 10. péntek

 

 havelda zoltan

Főosztály:
Beosztás:
Telefon:
Fax:
Szoba:
E-mail:

Növénybiotechnológia
Főosztályvezető
+36-28-526-155
+36-28-526-101
116
Ez az e-mail cím a spamrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát.

 

 

 

 havelda zoltan

Főosztály:
Beosztás:
Telefon:
Fax:
Szoba:
E-mail:

Növénybiotechnológia
Főosztályvezető
+36-28-526-155
+36-28-526-101
116
Ez az e-mail cím a spamrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát.

 

 

tudomanyos eletpalya

 

Tudományos Életpálya

 

A NAIK Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóközpont Növénybiotechnológiai Főosztályának vezetője (2011 – jelenleg)
Csoportvezető,  Növényi Fejlődésbiológiai Csoport (2011-jelenleg)
Csoportvezető, Növényi Virológia Csoport (2008 – 2011)
Tudományos főmunkatárs 2008-tól
Tudományos munkatárs,  Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóközpont (2001-2008)
EMBO ösztöndíj, John Innes Centre, Norwich, UK (1999-2001)
PhD  – Biológiai Tudományok, Szent-István Egyetem, Gödöllő, (1998)
Tudományos segédmunkatárs ill. PhD hallgató, Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóközpont (1991-1999)
M.Sc. –kertészmérnök, Kertészeti és Élelmiszeripari Egyetem, Budapest(1991)

 

 

kutatas

 

Kutatási terület

 

Csoportunk fő kutatási területe a kis szabályozó RNS-ek szerepének és szabályozó mechanizmusának vizsgálata a modell és gazdasági növények fejlődésében. Célunk olyan új és konzervatív szabályozó kis RNS-ek és növényi faktorok azonosítása, melyek szerepet játszanak a gazdaságilag fontos tulajdonságok kialakításában, illetve a növények általános fejlődési folyamataiban. Genom szerkesztési technológia felhasználása alap és alkalmazott kutatási célokra.

 

Kutatási témák

 

Kis RNS és mRNS transzkriptómok, szövet specifikus és genomszintű átfogó összehasonlításaCapsicum annuum-ban. (OTKA 2013-2017)

Az RNS interferencia végrehajtó komplexének szabályozásának és működésének vizsgálata modell és gazdaságilag fontos növényekben.

Mesterséges miRNS alapú vírusrezisztencia kialakítása árpában (OTKA 2010-2013)

 

Kis RNS és mRNS transzkriptómok, szövet specifikus és genomszintű átfogó összehasonlításaCapsicum annuum-ban. (OTKA 2013-2017)

A növényi fejlődési folyamatokat az mRNS-ek és a kis szabályozó RNS-ek összefüggő és hatékonyan szabályozott rendszere befolyásolja (kontrollálja). Napjaink egyik legintenzívebben kutatott tudományos területe a mind állatokban, mind növényekben jelenlevő, kis szabályozó RNS-ek (mikro (mi)RNS-ek) világának felfedezése. Az új generációs mélyszekevenálási technológiák megjelenése új utat nyitott a komplex, RNS–ek által szabályozott, folyamatok megismerésében és megértésében. A modell organizmusok tanulmányozásáról a termesztett növények tanulmányozására való áttérés azonban új kihívást jelent. A pályázat célja, hogy részletes információt gyűjtsön különböző Capsicum annuum (paprika) fajták RNS transzkriptomjának expressziójáról (működéséről). A paprika Magyarország fontos termesztett növénye: Hungarikum. Kutatásaink során mélyszekvenálási eljárással meghatározzuk paprikafajták különböző szöveteinek mRNS (RNSszek) és kisRNS (sRNSszek) profilját. Az így nyert adatok összehasonlító bioinformatikai elemzésével azonosítunk már ismert és új paprika specifikus kis RNS-(miRNS)-eket. Az ígéretes miRNS-ek biológiai fontosságát a legkorszerűbb molekuláris biológiai módszerekkel vizsgáljuk tovább. Az ősi (kis termés és eltérő növekedési erély) és a modern paprikafajták összehasonlító elemzése során azonosíthatóak lesznek az olyan miRNS-ek és mRNS-ek, melyek kulcsfontosságúak a gazdaságilag fontos tulajdonságok: növekedési erély, termés méret és alak, stb., kialakításában. Kutatásunk nemcsak leírja majd a paprika szervfejlődés során fontos szabályozó RNS-eket, hanem további részleteket fed fel a kis reguláló RNS-ek növényfejlődésben betöltött általános mechanizmusáról.


Az RNS interferencia végrehajtó komplexének szabályozásának és működésének vizsgálata modell és gazdaságilag fontos növényekben.

Az RNS interferencia a nem-kódoló kis RNS-ek (smRNS-ek) aktivitásán keresztül részt vesz gén kifejeződés, az epigenetikai jelenségek, stressz folyamatok szabályozásában és patogének elleni védekezésben. A smRNS-ek, mikró (mi) RNS-ek és kis interferáló (si) RNS-ek, képesek cél RNS-eiket  az RNS-ek lebontásával és/vagy transzlációs gátlásával szabályozni. Az RNS interferencia végrehajtó komplexének (RISC) központi molekulája az ARGONAUTE1 (AGO1) fehérje, amely részt vesz a siRNS és miRNS útvonalakban is. Az AGO1 fehérje saját kifejeződése is egy miRNS (miR168) által kontrolált folyamat jelezve egy lehetséges visszacsatolási szabályozási mechanizmust. Előzetes edényeink alapján az AGO1 szabályozás eltér a kanonikus miRNS-ek szabályozástól és fontos a RISC komplexbe épült biológiailag fontos smRNS-ek azonosítása. Célunk, hogy pontosan feltárjuk az AGO1 fehérje szövet szintű szabályozásának és működésének részleteit, hogy jobban megérthessük AGO1 szerepét a fejlődési folyamatokban. Kísérleteinkben molekulatömeg szűrési eljárással szeretnék meghatározni a biológiailag aktív, RISC-be épült smRNS-eket, amelyeket klónozás után új generációs szekvenálással vizsgálunk, hogy feltárjuk RISC-be történő beépülés szabályozási funkcióját. Egy új típusú funkció nyeréses mutagenezis rendszer megalapozásával reményein szerint új, eddig le nem írt RNS interferencia faktorokat tudunk azonosítani. Napjaink egyik legfontosabb kihívása a modell szervezeteken elért eredmények átültetése gazdaságilag fontos növényekre, ezért búza és paprika növényeket is bevonunk a kísérletekbe.

 

Mesterséges miRNS alapú vírusrezisztencia kialakítása árpában (OTKA 2010-2013)

A hazánkban termesztett növényfajok közül az őszi árpa vetésterületét illetően a búza és kukorica után harmadik legfontosabb növényünk (170-180 ezer ha körül), amit leginkább abraktakarmánynak, korai zöldtakarmánynak hasznosítanak az állattenyésztésben. Napjainkban már számolni kell az őszi árpa söripari valamint élelmiszeripari étékesíthetőségével is. Az EU-hoz történt csatlakozásunk tapasztalatai szerint fontos szerepet kapnak az értékesíthetőségi, a változó közgazdasági és jövedelmezőségi szempontok.

Az őszi árpa környezetkímélő termesztésének feltétele a fontosabb betegségekkel szemben ellenálló fajták előállítása, és a fogékony fajtáknak rezisztens fajtákkal történő lecserélése.

Az őszi árpát a gabonaféléket károsító vírusbetegségek közül a búza törpeség vírus (Wheat dwarf virus) fertőzi a leggyakrabban, mely egyúttal jelentős termésveszteséget és minőségi károsodást is okoz. Az említett vírusbetegség súlyos tüneteket idéz elő, melyek levélsárgulás és törpeség tünetek formájában nyilvánulnak meg. Az ősszel fertőzött növények gyenge gyökérzetet fejlesztenek, nagy részük a tél folyamán kifagy. A klasszikus nemesítés eddigi kísérletei nem hoztak sikert vírusrezisztens fajták előállítására, ezért fordulunk a biotechnológiai lehetőségek felé.  A pályázat keretében molekuláris biológiai eszközökkel, az RNS csendesítés (RNA silencing) néven ismert technológia segítségével hoztunk létre vírus rezisztens árpa vonalakat. A kutatások folytatásaként CRISPR/Cas9 genom szerkesztési eljárással tervezünk WDV rezisztens vonalakat előállítani.

 

allas


 

Álláslehetőség

 

csoporttagok

 

A csoport tagjai

 

                   

 

Dalmadi Ágnes
Tudományos munkatárs

 

 

Telefon: +36-28-526-140
Szoba: 113
E-mail: Ez az e-mail cím a spamrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát.

 

 

Kis András
PhD hallgató
2013-ig nappali ösztöndíjas
SZIE Növénytudományi doktori iskola

 

Telefon: +36-28-526-100
Szoba: 118
E-mail: Ez az e-mail cím a spamrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát.

 

Bálint Jeannette
tudományos gyakornok

 

Telefon: +36-28-526-100
Szoba:118
E-mail: Ez az e-mail cím a spamrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát.

 

Kósa Erzsike
Asszisztens

 

 


Telefon: +36-28-526-100
Szoba: 115
E-mail: Ez az e-mail cím a spamrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát.

 

Korábbi munkatársak:

 

 

Taller Dénes
PhD hallgató
2013-2016 nappali ösztöndíjas
Pannon Egyetem Keszthely, Növénytermesztési és Kertészeti
Tudományok Doktori Iskola

Telefon: +36-28-526-100
Szoba: 118

 

 

Dr. Várallyay Éva
Tudományos főmunkatárs


jelenleg MBK Diagnosztikai csoportvezető
Telefon: +36-28-526-140
Szoba: 113
E-mail: Ez az e-mail cím a spamrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát.

 

Oláh Enikő
MSc hallgató - ösztöndíjas
SZIE Növénytudományi Doktori Iskola


jelenleg MBK Diagnosztikai Csoport,
PhD hallgató
Telefon: +36-28-526-100
Szoba: 118


 

 

Ágyi Ákos
PhD hallgató

 

 

 



2013 ápr. 30-ig.

Kuglics Alexandra
MsC hallgató - szakdolgozó
ELTE TTK biológus

 

 

 


E-mail: Ez az e-mail cím a spamrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát.

 

publikaciok

 

Publikációk (2005 – jelenleg)

 

Tudományos közlemények

Oláh E, Pesti R, Taller D, Havelda Z, Várallyay É. (2016) Non-targeted effects of virus-induced gene silencing vectors on host endogenous gene expression.Arch Virol. 2016 Jun 9. (IF 2.2)

Nagy T, Kis A, Poliska S, Barta E, Havelda Z, Marincs F. (2016) Comparison of small RNA next-generation sequencing with and without isolation of small RNA fraction. Biotechniques.  Jun 1;60(6):273-8. (IF 2.9)

Baksa I, Nagy T, Barta E, Havelda Z, Várallyay É, Silhavy D, Burgyán J, Szittya G. (2015) Identification of Nicotiana benthamiana microRNAs and their targets using high throughput sequencing and degradome analysis. BMC Genomics. 16:1025. (IF 3.8)

Kis A, Tholt G, Ivanics M, Várallyay É, Jenes B, Havelda Z. (2016) Polycistronic artificial miRNA-mediated resistance to Wheat dwarf virus in barley is highly efficient at low temperature. Mol Plant Pathol. 17. (3):427-37. (IF 4.3)

Tombácz D, Csabai Z, Oláh P, Havelda Z, Sharon D, Snyder M, Boldogkői Z. (2015) Characterization of novel transcripts in pseudorabies virus. Viruses. 22;7(5):2727-44.

Éva Várallyay, Enikő Oláh and Zoltán Havelda (2014): Independent paralleled functions of p19 plant viral suppressor of RNA silencing required for effective suppressor activity. Nucleic Acids Res. 2013 Sep 22. 42: pp. 599-608. (IF:8,278)

Péter Vilmos, Ágnes Bujna, Milán Szuperák, Zoltán Havelda, Éva Várallyay, János Szabad, Lucie Kucerova, Kálmán Somogyi, Ildikó Kristó,Tamás Lukácsovich, Ferenc Jankovics, László Henn,Miklós Erdélyi (2013):The miR-282 Drosophila melanogaster microRNA gene regulates viability, longevity, and egg production. Genetics. 2013 Oct;195(2):469-80. doi: 10.1534/genetics.113.153585. Epub 2013 Jul 12. PMID: 23852386 (IF:4,007)

Akos Agyi, Zoltan Havelda (2013): Analyses of gradient like expression of miR167 in Arabidopsis thaliana embryonic tissue. Journal of Plant Biology October 2013, Volume 56, Issue 5, pp 336-344

Éva Várallyay and Zoltán Havelda (2013): Unrelated viral suppressors of RNA silencing mediate the control of ARGONAUTE1 level . Molecular Plant Pathology 2013 Aug;14(6):567-75. doi: 10.1111/mpp.12029. Epub 2013 Apr 11. (IF:3,899)

Zsolt Czimmerer, Julianna Hulvely, Zoltan Simandi, Eva Varallyay, Zoltan Havelda, Erzsebet Szabo, Attila Varga, Balazs Dezso, Maria Balogh, Attila Horvath, Balint Domokos, Zsolt Torok, Laszlo Nagy, Balint L. Balint (2013). A versatile method to design stem-loop primer-based quantitative PCR assays for detecting small regulatory RNA molecules. PLoS One. 2013;8(1):e55168. doi: 10.1371/journal.pone.0055168. Epub 2013 Jan 31.PMID: 23383094 (IF:4,092)

Burgyán, J. andHavelda Z (2011) Viral suppressors of RNA silencing Trends in Plant Science Volume 16, Issue 5, May 2011, Pages 265-272 (IF:10,095)

Várallyay E, Válóczi A, Agyi A, Burgyán J and  Havelda Z (2010) Plant virus-mediated induction of miR168 is associated with repression of ARGONAUTE1 accumulation. The EMBO Journal, 20;29(20):3507-19.(IF:10,124)

Varallyay E*, Lichner Z, Safrany J, Havelda Z, Salamon P, Bisztray G, Burgyan J. (2010)  Development of a virus induced gene silencing vector from a legumes infecting tobamovirus.  Acta Biologica Hungarica, 2010 61(4) 457-469 (IF:0,551)

Havelda Z, Varallyay E, Valoczi A and Burgyan J (2008) Plant virus infection-induced persistent host gene downregulation in systemically infected leaves. Plant Journal, 55:(2) pp. 278-288. (IF:6,75)

Várallyay E., Burgyan J. and Havelda Z. (2008)MicroRNA detection by northern blotting using locked nucleic acid probe.Nature Protocols, 3:(2) 190-196. (IF:4,17)

Várallyay E., Burgyan J. and Havelda Z. (2007) Detection of microRNAs by northern blot analyses using LNA probes. METHODS: A COMPANION TO METHODS IN ENZYMOLOGY, 43 (2) : 140-45 (IF:3,81)

Valoczi A, Varallyay E, Kauppinen S, Burgyan J, Havelda Z. (2006) Spatio-temporal accumulation of microRNAs is highly coordinated in developing plant tissues. Plant J. 47(1):140-51. (IF:6,97)
 

Tudományos közlemények magyar nyelven

 

Varallyay E , Valoczi A., Burgyan, J., Havelda Z. (2009) Vírusos fertőzés indukálta génexpressziós változások vizsgálata növényekben Növényvédelem, 2009, 45 (3), 109-114.

Salamon Pál, Várallyay Éva, Nemes Katalin és Salánki Katalin (2010) Termesztett és vadon élô burgonyafélék vírusos betegségei és vírusai magyarországon. 7. Az uborka mozaik vírus (cucumber mosaic virus, cmv) fehér törzsének elôfordulása dohányon (nicotiana tabacum l.) És a cmv-ntw izolátum tulajdonságai. Növényvédelem, 2010, 46 (5), 218-225

Varallyay E, Vida G, Giczey G, Veisz O, Burgyan J, Havelda Z (2010) Egyszerű festési eljárás egyszikűek  lisztharmatfertőzésének megállapítására és alkalmazása búzafajták jellemzésére, Növényvédelem, 2010, 46 (5), 233-239

 

Összefoglalók és könyvfejezetek

Várallyay E. and Havelda Z. (2011)Detection of microRNAs in plants by in situ hybridisation. .In MicroRNAs in Development. Methods in Molecular Biology 732, Humana Press, (Edited by Tamas Dalmay)pp. 9-23.

Havelda Z. (2010) In situ detection of miRNAs using LNA probes. In Plant MicroRNAs. Methods in Molecular Biology 592, Humana Press, (Edited by Pamela Green and Blake C. Meyers) pp. 127-136.

Havelda Z. (2009) Biogenesis and function of plant microRNAs. In Regulation of Gene Expression by Small RNAs., CRC press, (Edited by Dr. John Rossi and Rajesh K. Gaur) 173-196.

Kauppinen S. and Havelda Z. (2008) Detection of siRNAs and miRNAs. Plant Virology Protocols in the Methods in Molecular Biology, Humana Press, (Edited by P. Nagy, G. Foster and E. Johansen) pp. 217-227.

Maule A.J. and Havelda Z. (2008) In situ detection of plant viruses and virus-specific products. Plant Virology Protocols in the Methods in Molecular Biology, Humana Press, (Edited by P. Nagy, G. Foster and E. Johansen) pp. 201-216 .

WheelerG, ValocziA, HaveldaZ and DalmayT. (2007) In situ detection of animal and plant microRNAs. DNA and Cell Biology, 26(4):251-5.
 

Copyright 2011 Növényi Fejlődésbiológia Csoport – Dr. Havelda Zoltán.
Templates Joomla 1.7 by Wordpress themes free