Epigenetikai Csoport - Dr. Szittya György

Utolsó frissítés: 2017. április 13. csütörtök Megjelent: 2012. február 14. kedd

 

szittya gyorgy

Főosztály:
Beosztás:
Telefon:
Fax:
Szoba:
E-mail:
Researcher ID:
ResearchGate:

Növénybiotechnológia
tudományos főmunkatárs
06-28-526-230
06-28-526-101
120
Ez az e-mail cím a spamrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát.
A-2905-2012
https://www.researchgate.net/profile/Gyoergy_Szittya

 

 

szittya gyorgy

Főosztály:
Beosztás:
Telefon:
Fax:
Szoba:
E-mail:
Researcher ID:
ResearchGate:

Növénybiotechnológia
tudományos főmunkatárs
06-28-526-230
06-28-526-101
120
Ez az e-mail cím a spamrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát.
A-2905-2012
https://www.researchgate.net/profile/Gyoergy_Szittya

 

tudomanyos eletpalya

 

Tudományos Életpálya

 

Csoportvezető, NAIK - MBK (2012 – jelenleg)
Tudományos munkatárs, University of East Anglia, Norwich, UK (2007 – 2011)
Tudományos munkatárs, Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóközpont (2005 – 2007)
EMBO fellow, John Innes Centre, Norwich, UK (2003 – 2005)
Ph.D. – Biológia, Eötvös Loránd Tudományegyetem, Budapest (2003)
M.Sc. - Biotechnológia Szak, Gödöllői Agrártudományi Egyetem (1995)

 

kutatas

 

Kutatási terület

 

Csoportunk a kis szabályozó RNS-ek (sRNS) szerepét vizsgálja növényekben. Munkánk során, összehasonlító genom szintű sRNS analízissel és sRNS biogenezis mutánsok felhasználásával szeretnénk azonosítani, hogy a sRNS-ek milyen szerepet játszanak a növényi gének szabályozásában növény – mikróba kölcsönhatás során.

Kutatási témák

 

A kis RNS-ek szerepe az NB-LRR típusú növényi rezisztencia géncsalád szabályozásában – OTKA kutatási pályázat keretében.

A vírustünetek kialakulásáért felelős növényi faktorok molekuláris azonosítása – NKFIH kutatási pályázat keretében.

A kis RNS-ek szerepe az NB-LRR típusú növényi rezisztencia géncsalád szabályozásában – OTKA kutatási pályázat keretében.

 

Századunk egyik legfontosabb kérdése, hogy miként tudunk elegendő élelmiszert előállítani a Föld egyre növekvő népességének. A humán populáció továbbra is folyamatosan gyarapszik, és úgy becslik, hogy 2050-re eléri a 9 milliárdot. Mivel az élelmiszertermelésre fordítható földterület elérte a maximumát, az élelmiszerbiztonság megőrzése csak úgy érhető el, ha növelni tudjuk a termésátlagokat és ezzel egyidőben tudjuk csökkenteni a termésveszteségeket is. A növényi patogének jelentős károkat okoznak a mezőgazdaságban és az általuk okozott termésveszteséget 15 %-ra becsülik a legfontosabb termények esetében. A leghatékonyabb és egyben legkörnyezetkímélőbb növényvédelmi módszer a természetes rezisztenciák teljes mértékű kihasználása lenne. Mivel a növények az evolúció során az őket megtámadó patogénekkel közösen fejlődtek, ennek a „fegyverkezési” versenynek az eredményéül számos patogén felismerési és védelmi rendszert alakítottak ki, amit ki lehet használni a növényvédelemben is. Az egyik ilyen rendszer a növényi „immun receptorok”, amelyek felismernek bizonyos patogéneket és rezisztenca választ indukálnak. Azonban a rezisztenciagének nagyfokú mezőgazdasági jelentősége ellenére sincs elég ismeretünk ezeknek a géneknek az expresszióját szabályozó mechanizmusokról. Az elmúlt évek során vált ismertté, hogy a rövid nem kódoló RNS molekuláknak fontos szerepe van a gén expresszió szabályozásában. A jelen pályázatban azt vizsgáljuk, hogy a rövid nem kódoló RNS molekulák miként szabályozzák a rezisztenciagéneket mikrobákkal történő kapcsolat során. A kutatás során szerzett ismeretek felhasználhatóak lesznek új típusú patogén rezisztenciát hordozó, betegség ellenálló növények nemesítése során.

 

A vírustünetek kialakulásáért felelős növényi faktorok molekuláris azonosítása


A növényi vírusok rendkívül változatos tüneteket és gyakran komoly gazdasági károkat okoznak, ezzel veszélyeztetve az élelmiszer ellátás biztonságát. Ennek ellenére nagyon kevés ismeret áll a rendelkezésünkre a vírustüneteket kialakító molekuláris mechanizmusok növényi génjeiről. Kutatásunk célja, hogy tanulmányozzuk a tünetek kialakulásának molekuláris hátterét, és azonosítsuk a vírustünetek enyhítéséért felelős növényi géneket. Ha sikerül megértenünk a tünetek kialakulásának folyamatát, akkor lehetőségünk nyílik arra, hogy gazdaságilag fontos növényekben mérsékeljük a vírustünetek súlyosságát és ez által a vírusfertőzések okozta termésveszteséget is.
 

allas

 

Munkalehetőségek
 

A gén csendesítés témája iránt érdeklődő PhD hallgatók, BSc vagy MSc diploma témát kereső diákok jelentkezését szeretettel várjuk csoportunkba.

A jelentkezéseket a Ez az e-mail cím a spamrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát. címre kérjük küldeni.

 

csoporttagok

 

A csoport tagjai

 


 

Baksa Ivett,
PhD hallgató
Tudományos segédmunkatárs

E-mail: Ez az e-mail cím a spamrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát.

M.Sc.: Debreceni Egyetem, Általános Orvostudományi Kar,
Molekuláris biológia szak, 2009-2011
Doktori Iskola: ELTE, Biológia Doktori Iskola,
Klasszikus és Molekuláris Genetika program, 2013-2016
Témavezető: Dr. Szittya György

Labor: 106
Telefon: +36-28-526-154
 


 

Kis Szilvia, PhD hallgató
Tudományos segédmunkatárs

E-mail: Ez az e-mail cím a spamrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát.

M.Sc.: Szent István Egyetem, MKK, okleveles mezőgazdasági biotechnológus (2011-2013)
Doktori Iskola: Kutatói utánpótlást elősegítő program és a Szent István Egyetem,
Növénytudományi Doktori Iskola PhD hallgatója (2014 - )
Témavezető: Dr. Szittya György

Labor: 106
Telefon: +36-28-526-154


 

Dr. Gyula Péter
Tudományos munkatárs

E-mail: Ez az e-mail cím a spamrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát.

M.Sc.: TTK biológus, molekuláris biológus és biotechnológus szakirány,
József Attila Tudományegyetem, Szeged (1999)
Ph.D.: TTK Molekuláris- és Sejtbiológia Doktori Iskola, Szegedi Tudományegyetem, Szeged (2009)

Szoba: 119
Telefon: +36 28 526139

Researcher ID: N-4445-2014
ResearchGate: https://www.researchgate.net/profile/Peter_Gyula

 


 

Dr. Sós-Hegedűs Anita
Tudományos munkatárs

E-mail: Ez az e-mail cím a spamrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát.

M.Sc.: biológus KLTE, Debrecen, (1997)
Ph.D.: ELTE Biológia Doktori Iskola Kísérletes Növénybiológia program, (2005)

Labor: 106
Telefon: +36-28-526-154

 

szigeti aniko
 

Tóth Tamás
Intézeti mérnök

E-mail: Ez az e-mail cím a spamrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát.

M.Sc.:Debreceni Egyetem, TTK Biológus szak 2014-2016

Labor: 106
Telefon:  +36-28-526-154

 

publikaciok

 

Tudományos közlemények (2007 - jelenleg)

 

Baksa, I., Nagy, T., Barta, E., Havelda, Z., Várallyay, E., Silhavy, D., Burgyán, J.,Szittya, G. (2015). Identification of Nicotiana benthamiana microRNAs and their targets using high throughput sequencing and degradome analysis. BMC Genomics, 16:1025. doi: 10.1186/s12864-015-2209-6.

Szittya, G.and Burgyán, J. (2013) RNA interference-mediated intrinsic antiviral immunity in plants. Curr Top Microbiol Immunol. 371: 153-81.

Lopez-Gomollon, S., Mohorianu, I., Szittya, G., Moulton, V. and Dalmay, T. (2012). Diverse correlation patterns between microRNAs and their targets during tomato fruit development indicates different modes of microRNA actions. Planta, 236 (6): 1875-1887.

Folkes, L., Moxon, S., Woolfenden, H.C., Stocks, M.B., Szittya, G., Dalmay, T. and Moulton V. (2012). PAREsnip: a tool for rapid genome-wide discovery of small RNA/target interactions evidenced through degradome sequencing. Nucleic Acids Res., 1–10 doi:10.1093/nar/gks277

Mohorianu, I., Schwach, F., Jing, R., Lopez-Gomollon, S., Moxon, S., Szittya,G., Sorefan, K., Moulton, V. and Dalmay T. (2011). Profiling of short RNAs during fleshy fruit development reveals stage-specific sRNAome expression patterns. Plant Journal, 67 (2): 232-246.

Szittya, G., Moxon, S., Pantaleo, V., Toth, G., Rusholme Pilcher, R.L., Moulton, V., Burgyan, J. and Dalmay, T. (2010). Structural and functional analysis of viral siRNAs. PLoS Pathogens 6 (4): e1000838. doi:10.1371/journal.ppat.1000838

Pantaleo, V.*, Szittya, G.*, Moxon, S., Miozzi, L., Moulton, V., Dalmay, T. and Burgyan, J. (2010). Identification of grapevine microRNAs and their targets using high throughput sequencing and degradome analysis. Plant Journal,62 (6): 960-976
* Társ-elsőszerző

Szittya, G., Moxon, S., Santos, D.M., Jing, R., Fevereiro, M.P., Moulton, V. and Dalmay, T. (2008). High-throughput sequencing of Medicago truncatula short RNAs identifies eight new miRNA families. BMC Genomics9:593.

Moxon, S.*, Jing, R.*, Szittya, G.*, Schwach, F., Rusholme Pilcher, R.L., Moulton, V. and  Dalmay, T. (2008). Deep sequencing of tomato short RNAs identifies microRNAs targeting genes involved in fruit ripening. Genome Research,18 (10):1602-1609.
*Társ-elsőszerző

Szittya, G., Dalmay, T. and Burgyan, J. (2008). Plant Antiviral Defense: Gene Silencing Pathway. Encyclopedia of Virology, 5 vols. (B.W.J. Mahy and M.H.V. Van Regenmortel, Editors), pp. 141-149 Oxford: Elsevier.

Pantaleo V., Szittya G., Burgyán J. (2007). Molecular bases of viral RNA targeting by viral siRNA programmed RISC. Journal of Virology, 81 (8):3797-3806.

blog

 

Copyright 2011 Epigenetikai Csoport.
Templates Joomla 1.7 by Wordpress themes free